Выбираю оплату Visa/Mastercard, а мне предлагается оплата через Яндекс.Деньги

Всё правильно.
Мы, как и любая другая организация, принимаем большинство платежей через посредников - агрегаторов. Наш основной агрегатор - Яндекс.Деньги. Обратите внимание: несмотря на то, что он агрегирует большинство способов оплаты - вам, как плательщику совсем не обязательно иметь Яндекс кошелёк. Достаточно указать сумму к оплате, выбрать интересующий вас способ, скажем, оплата картой или оплата через мобильного оператора, и следовать подсказкам системы.